蛋白质翻译
使用标准遗传密码将 DNA 或 RNA 编码序列翻译为蛋白质。选择一个阅读框,如果需要,可以在遇到第一个终止密码子时停止。接受 FASTA 输入,U 按 T 处理。
阅读框:
在上方粘贴编码序列以进行翻译。
使用方法
遗传密码每次读取三个碱基。每个三联体(密码子)指定一个氨基酸,64 个密码子中有三个表示翻译终止。此工具从所选阅读框开始,将你的序列拆分为密码子,并在标准遗传密码(NCBI 密码表 1)中逐一查找,用单字母代码表示氨基酸,用星号表示终止密码子。
由于序列可以根据起始位置以三种正向阅读框读取,请选择从真正的起始密码子(通常是 ATG)开始的阅读框。开启“在第一个终止密码子处停止”可只翻译到终止子为止的开放阅读框。RNA 中的尿嘧啶按胸腺嘧啶处理,FASTA 标题、空格和数字会被忽略。
示例
- ATGGCC → M A(Met-Ala)。
- ATG TTT TAA → M F *(以终止子结尾的短开放阅读框)。
- 将 AATGGCC 移至 +2 阅读框读取为 ATG GCC → M A。
常见问题
- 什么是阅读框?
- 阅读框是指从哪里开始将碱基分组为三联体。一个序列有三种可能的正向阅读框(从位置 1、2 或 3 开始),正确的阅读框应从起始密码子开始。
- 使用的是哪种遗传密码?
- 标准遗传密码(NCBI 翻译表 1),适用于大多数核基因。细胞器及部分特定生物的密码在少数密码子上有所不同。
- 星号代表什么?
- 星号标记终止密码子(TAA、TAG 或 TGA),表示翻译终止。启用“在第一个终止密码子处停止”可让蛋白质在此处结束。
- 可以翻译 RNA 吗?
- 可以。尿嘧啶(U)按胸腺嘧啶(T)处理,因此 mRNA 序列翻译出的蛋白质与其 DNA 相同。