Phred 质量分数转换器
将 Phred 质量分数转换为碱基判读的错误概率和准确率，并查看 FASTQ 文件中使用的 Phred+33 和 Phred+64 ASCII 字符。你也可以将错误概率转换回 Q 分数。
碱基判读准确率99%
- 错误概率
- 1.00e-2
- Phred+33 字符
- 5
- Phred+64 字符
- T
输入 0 到 1 之间的错误概率以获得 Q 分数。
使用方法
Phred 质量分数 Q 以对数刻度编码碱基判读出错的概率 P：P = 10^(−Q/10)，因此 Q = −10 × log10(P)。分数越高表示判读越可信——Q20 表示错误率为 1/100（99% 准确率），Q30 为 1/1000（99.9%），Q40 为 1/10000（99.99%）。
在 FASTQ 文件中，该分数以单个 ASCII 字符存储。Sanger 测序及现代 Illumina 使用 Phred+33（将 33 加到 Q 上并取相应字符），而较旧的 Illumina 流程使用 Phred+64。输入 Q 分数即可查看其概率、准确率及两种字符，或输入错误概率获得对应的 Q 值。
示例
- Q20 → 错误概率 1e-2 → 99% 准确率 → Phred+33 字符 '5'。
- Q30 → 1e-3 → 99.9% 准确率 → Phred+33 字符 '?'。
- Q40 → 1e-4 → 99.99% 准确率 → Phred+33 字符 'I'。
常见问题
- 什么是 Phred 质量分数？
- 它是衡量 DNA 测序中碱基判读可信度的指标，定义为 Q = −10 × log10(P)，其中 P 是判读出错的概率。
- Phred+33 和 Phred+64 有什么区别？
- 它们是 FASTQ 文件中该分数的两种 ASCII 编码方式。Phred+33（Sanger、Illumina 1.8+）将 33 加到 Q 上；Phred+64（较旧的 Illumina）将 64 加到 Q 上。要正确解码质量值，必须使用正确的偏移量。
- Q30 意味着什么准确率？
- Q30 对应错误概率 0.001，即 99.9% 的碱基判读准确率——一千个碱基中有一个错误。这是测序读段常用的质量阈值。
- 如何将概率转换为 Q？
- 使用 Q = −10 × log10(P)。在第二个字段中输入错误概率，计算器会返回 Q 分数。