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GC 含量计算器

粘贴 DNA 或 RNA 序列即可获得其 GC 含量、AT 含量和碱基组成。FASTA 标题、空格和数字会被忽略,U 按 T 计数。

在上方粘贴序列以查看其 GC 含量。

使用方法

GC 含量是核酸中鸟嘌呤(G)或胞嘧啶(C)碱基所占的比例,以百分比表示:GC% = (G + C) ÷ (A + T + G + C) × 100。由于 G–C 碱基对由三个氢键(而非两个)连接,GC 含量与序列的解链温度和稳定性相关。

粘贴序列后,计算器会报告 GC 百分比、互补的 AT 百分比、长度以及每种碱基的计数。FASTA 标题、换行、空格和数字会被自动去除,RNA 中的尿嘧啶(U)会与胸腺嘧啶(T)一并计数。

示例

  • GGCC → GC 含量 100%。
  • ATGC → GC 含量 50%,AT 含量 50%。
  • GC 含量 60% 的区域比长度相同、GC 含量 40% 的区域解链温度更高。

常见问题

什么是 GC 含量?
GC 含量是序列中由鸟嘌呤和胞嘧啶组成的百分比。计算方法为 (G + C) 除以碱基总数,再乘以 100。
为什么 GC 含量很重要?
G–C 配对有三个氢键,而 A–T 只有两个,因此 GC 含量越高,DNA 的解链温度和稳定性也越高。它还会影响 PCR 引物设计,并反映基因组特征。
适用于 RNA 吗?
适用。尿嘧啶(U)会按胸腺嘧啶(T)计数,因此 RNA 序列也能得到正确的 GC 含量。
可以粘贴什么样的输入?
纯序列或 FASTA 格式均可。以 > 开头的行会被忽略,空白和数字会被去除,因此可以直接从 FASTA 文件粘贴。