Tradução de Proteínas
Traduza uma sequência codificante de ADN ou ARN em proteína usando o código genético padrão. Escolha uma grelha de leitura e, se quiser, pare no primeiro codão de paragem. Aceita entrada FASTA e U é lido como T.
Cole uma sequência codificante acima para a traduzir.
Como funciona
O código genético lê uma sequência de nucleótidos três bases de cada vez. Cada trinca, ou codão, especifica um aminoácido, e três dos 64 codões assinalam o fim da tradução. Esta ferramenta divide a sua sequência em codões a partir da grelha de leitura escolhida e consulta cada um no código genético padrão (tabela 1 do NCBI), escrevendo os aminoácidos como códigos de uma letra e os codões de paragem como um asterisco.
Como uma sequência pode ser lida em três grelhas diretas consoante o ponto de início, escolha a grelha que começa no codão de início real (normalmente ATG). Ative “parar no primeiro codão de paragem” para traduzir apenas a grelha de leitura aberta até ao seu terminador. O uracilo em ARN é tratado como timina, e os cabeçalhos FASTA, espaços e números são ignorados.
Exemplos
- ATGGCC → M A (Met-Ala).
- ATG TTT TAA → M F * (uma grelha de leitura aberta curta que termina num codão de paragem).
- Passando para a grelha +2 de AATGGCC lê-se ATG GCC → M A.
Perguntas frequentes
- O que é uma grelha de leitura?
- Uma grelha de leitura é o ponto a partir do qual se começam a agrupar as bases em trincas. Uma sequência tem três grelhas diretas possíveis (começando na posição 1, 2 ou 3), e a correta começa no codão de início.
- Que código genético é usado?
- O código genético padrão (tabela de tradução 1 do NCBI), que se aplica à maioria dos genes nucleares. Os códigos de organelos e alguns códigos específicos de organismos diferem em alguns codões.
- O que significa o asterisco?
- Um asterisco assinala um codão de paragem (TAA, TAG ou TGA), que termina a tradução. Ative “parar no primeiro codão de paragem” para terminar a proteína aí.
- Traduz ARN?
- Sim. O uracilo (U) é lido como timina (T), pelo que uma sequência de mRNA se traduz na mesma proteína que o seu ADN.