Conversor de Pontuação de Qualidade Phred
Converta uma pontuação de qualidade Phred na sua probabilidade de erro de chamada de base e precisão, e veja os caracteres ASCII Phred+33 e Phred+64 usados em ficheiros FASTQ. Também pode converter uma probabilidade de erro de volta para uma pontuação Q.
- Probabilidade de erro
- 1.00e-2
- Carácter Phred+33
- 5
- Carácter Phred+64
- T
Introduza uma probabilidade de erro entre 0 e 1 para obter a pontuação Q.
Como funciona
Uma pontuação de qualidade Phred Q codifica a probabilidade P de uma chamada de base estar errada, numa escala logarítmica: P = 10^(−Q/10), pelo que Q = −10 × log10(P). Uma pontuação mais alta significa uma chamada mais confiante — Q20 corresponde a uma taxa de erro de 1 em 100 (99% de precisão), Q30 a 1 em 1000 (99,9%), e Q40 a 1 em 10000 (99,99%).
Nos ficheiros FASTQ, a pontuação é armazenada como um único carácter ASCII. O Sanger e o Illumina moderno usam Phred+33 (somar 33 a Q e usar esse carácter), enquanto pipelines Illumina mais antigos usavam Phred+64. Introduza uma pontuação Q para ver a sua probabilidade, precisão e ambos os caracteres, ou introduza uma probabilidade de erro para obter o Q equivalente.
Exemplos
- Q20 → probabilidade de erro 1e-2 → 99% de precisão → carácter Phred+33 '5'.
- Q30 → 1e-3 → 99,9% de precisão → carácter Phred+33 '?'.
- Q40 → 1e-4 → 99,99% de precisão → carácter Phred+33 'I'.
Perguntas frequentes
- O que é uma pontuação de qualidade Phred?
- É uma medida da confiança de uma chamada de base em sequenciação de ADN, definida como Q = −10 × log10(P), sendo P a probabilidade de a chamada estar errada.
- Qual é a diferença entre Phred+33 e Phred+64?
- São duas codificações ASCII da pontuação em ficheiros FASTQ. O Phred+33 (Sanger, Illumina 1.8+) soma 33 a Q; o Phred+64 (Illumina mais antigo) soma 64. É necessário o offset correto para descodificar as qualidades.
- Que precisão significa Q30?
- Q30 corresponde a uma probabilidade de erro de 0,001, ou 99,9% de precisão na chamada de base — uma base errada em mil. É um limiar de qualidade comum para leituras de sequenciação.
- Como converto a probabilidade em Q?
- Use Q = −10 × log10(P). Introduza a probabilidade de erro no segundo campo e a calculadora devolve a pontuação Q.