Calculadora de Conteúdo GC
Cole uma sequência de ADN ou ARN para obter o seu conteúdo em GC, conteúdo em AT e composição de bases. Cabeçalhos FASTA, espaços e números são ignorados, e U é contado como T.
Cole uma sequência acima para ver o seu conteúdo GC.
Como funciona
O conteúdo GC é a fração de bases de um ácido nucleico que são guanina (G) ou citosina (C), expressa em percentagem: GC% = (G + C) ÷ (A + T + G + C) × 100. Como os pares de bases G–C são unidos por três ligações de hidrogénio em vez de duas, o conteúdo GC está correlacionado com a temperatura de fusão e a estabilidade da sequência.
Cole uma sequência e a calculadora indica a percentagem de GC, a percentagem complementar de AT, o comprimento e a contagem de cada base. Os cabeçalhos FASTA, quebras de linha, espaços e números são removidos automaticamente, e o uracilo (U) do ARN é contado juntamente com a timina (T).
Exemplos
- GGCC → conteúdo GC de 100%.
- ATGC → conteúdo GC de 50%, conteúdo AT de 50%.
- Uma região com 60% de GC funde a uma temperatura mais alta do que uma região com 40% de GC do mesmo comprimento.
Perguntas frequentes
- O que é o conteúdo GC?
- O conteúdo GC é a percentagem de uma sequência composta por guanina e citosina. É calculado como (G + C) dividido pelo número total de bases, vezes 100.
- Porque é que o conteúdo GC importa?
- Os pares G–C têm três ligações de hidrogénio contra duas dos pares A–T, pelo que um conteúdo GC mais elevado aumenta a temperatura de fusão e a estabilidade do ADN. Também afeta o desenho de primers para PCR e reflete características do genoma.
- Funciona para ARN?
- Sim. O uracilo (U) é contado como timina (T), pelo que as sequências de ARN dão o conteúdo GC esperado.
- Que entrada posso colar?
- Sequência simples ou FASTA. As linhas que começam por > são ignoradas e os espaços em branco e números são removidos, pelo que colar diretamente de um ficheiro FASTA funciona.