Conversor de Escore de Qualidade Phred
Converta um escore de qualidade Phred em sua probabilidade de erro de chamada de base e precisão, e veja os caracteres ASCII Phred+33 e Phred+64 usados em arquivos FASTQ. Você também pode converter uma probabilidade de erro de volta em um escore Q.
- Probabilidade de erro
- 1.00e-2
- Caractere Phred+33
- 5
- Caractere Phred+64
- T
Informe uma probabilidade de erro entre 0 e 1 para obter o escore Q.
Como funciona
Um escore de qualidade Phred Q codifica a probabilidade P de que uma chamada de base esteja errada, em escala logarítmica: P = 10^(−Q/10), então Q = −10 × log10(P). Um escore mais alto significa uma chamada mais confiável — Q20 corresponde a uma taxa de erro de 1 em 100 (99% de precisão), Q30 é 1 em 1000 (99,9%) e Q40 é 1 em 10000 (99,99%).
Em arquivos FASTQ, o escore é armazenado como um único caractere ASCII. Sanger e Illumina moderno usam Phred+33 (some 33 ao Q e pegue esse caractere), enquanto pipelines antigos da Illumina usavam Phred+64. Informe um escore Q para ver sua probabilidade, precisão e ambos os caracteres, ou informe uma probabilidade de erro para obter o Q equivalente.
Exemplos
- Q20 → probabilidade de erro 1e-2 → 99% de precisão → caractere Phred+33 '5'.
- Q30 → 1e-3 → 99,9% de precisão → caractere Phred+33 '?'.
- Q40 → 1e-4 → 99,99% de precisão → caractere Phred+33 'I'.
Perguntas frequentes
- O que é um escore de qualidade Phred?
- É uma medida da confiança de uma chamada de base no sequenciamento de DNA, definida como Q = −10 × log10(P), onde P é a probabilidade de a chamada estar errada.
- Qual a diferença entre Phred+33 e Phred+64?
- São duas codificações ASCII do escore em arquivos FASTQ. Phred+33 (Sanger, Illumina 1.8+) soma 33 ao Q; Phred+64 (Illumina antigo) soma 64. O deslocamento correto é necessário para decodificar as qualidades.
- Que precisão o Q30 representa?
- Q30 corresponde a uma probabilidade de erro de 0,001, ou 99,9% de precisão na chamada de base — uma base errada a cada mil. É um limiar de qualidade comum para leituras de sequenciamento.
- Como converto probabilidade em Q?
- Use Q = −10 × log10(P). Informe a probabilidade de erro no segundo campo e a calculadora retorna o escore Q.