Calculadora de Conteúdo GC
Cole uma sequência de DNA ou RNA para obter seu conteúdo GC, conteúdo AT e composição de bases. Cabeçalhos FASTA, espaços e números são ignorados, e U é contado como T.
Cole uma sequência acima para ver seu conteúdo GC.
Como funciona
O conteúdo GC é a fração de bases em um ácido nucleico que são guanina (G) ou citosina (C), expressa como percentual: GC% = (G + C) ÷ (A + T + G + C) × 100. Como os pares de bases G-C são mantidos por três ligações de hidrogênio em vez de duas, o conteúdo GC se correlaciona com a temperatura de fusão e a estabilidade da sequência.
Cole uma sequência e a calculadora informa o percentual de GC, o percentual complementar de AT, o comprimento e a contagem de cada base. Cabeçalhos FASTA, quebras de linha, espaços e números são removidos automaticamente, e a uracila (U) do RNA é contada junto com a timina (T).
Exemplos
- GGCC → conteúdo GC de 100%.
- ATGC → conteúdo GC de 50%, conteúdo AT de 50%.
- Uma região com 60% de GC funde em uma temperatura mais alta que uma região com 40% de GC do mesmo comprimento.
Perguntas frequentes
- O que é conteúdo GC?
- Conteúdo GC é o percentual de uma sequência composto por guanina e citosina. É calculado como (G + C) dividido pelo número total de bases, multiplicado por 100.
- Por que o conteúdo GC importa?
- Pares G-C têm três ligações de hidrogênio contra duas dos pares A-T, então um conteúdo GC maior eleva a temperatura de fusão e a estabilidade do DNA. Também afeta o desenho de primers de PCR e reflete características do genoma.
- Funciona com RNA?
- Sim. A uracila (U) é contada como timina (T), então sequências de RNA fornecem o conteúdo GC esperado.
- Que tipo de entrada posso colar?
- Sequência simples ou FASTA. Linhas que começam com > são ignoradas e espaços e números são removidos, então colar diretamente de um arquivo FASTA funciona.