Omgekeerd-complementcalculator
Plak een DNA- of RNA-sequentie om het omgekeerde complement, complement of de omkering te krijgen. IUPAC-ambiguïteitscodes worden verwerkt en FASTA-headers, spaties en cijfers worden genegeerd.
Plak hierboven een sequentie om het resultaat te zien.
Hoe het werkt
Het complement van een DNA-streng koppelt elke base aan zijn Watson-Crick-partner: A met T, G met C (en A met U in RNA). Het omgekeerde complement keert die complementaire streng om, wat de sequentie geeft die je op de tegenoverliggende streng zou lezen in de 5′→3′-richting — precies wat je nodig hebt bij het ontwerpen van een reverse-primer of het interpreteren van de antisense-streng.
Plak een sequentie en kies omgekeerd complement, alleen complement of alleen omkering. IUPAC-ambiguïteitscodes (R, Y, N en de rest) worden correct gecomplementeerd, en alles wat geen letter is — FASTA-headers, regeleinden, spaties, positienummers — wordt vóór verwerking verwijderd. Vink RNA-uitvoer aan om het resultaat te schrijven met U in plaats van T.
Voorbeelden
- ATGC → omgekeerd complement → GCAT.
- 5′-ATGCTAGC-3′ → omgekeerd complement → GCTAGCAT (de reverse-strand primer).
- Ambiguïteitscodes: R (A/G) complementeert naar Y (C/T).
Veelgestelde vragen
- Wat is een omgekeerd complement?
- Het is de sequentie van de tegenoverliggende DNA-streng, gelezen 5′→3′. Je complementeert elke base (A↔T, G↔C) en keert daarna de volgorde om.
- Werkt het met RNA?
- Ja. Vink RNA-uitvoer aan en het resultaat wordt geschreven met U in plaats van T. U in de invoer wordt behandeld als gelijkwaardig aan T.
- Hoe zit het met ambiguïteitscodes?
- Alle IUPAC-nucleotidecodes worden ondersteund en correct gecomplementeerd, bijvoorbeeld R (purine) wordt Y (pyrimidine) en N blijft N.
- Kan ik FASTA plakken?
- Ja. Regels die beginnen met > worden genegeerd, en witruimte en cijfers worden automatisch verwijderd, zodat je rechtstreeks vanuit een FASTA-bestand kunt plakken.