DNA-/RNA-molecuulgewichtcalculator
Bereken het molecuulgewicht van een oligonucleotide uit de sequentie. Kies enkelstrengs DNA, dubbelstrengs DNA of enkelstrengs RNA; de calculator telt de residumassa's op met de standaardformules.
Vul een nucleotidesequentie in (A, C, G, T/U) om het molecuulgewicht te berekenen.
Hoe het werkt
Het molecuulgewicht van een oligonucleotide is de som van de massa's van de nucleotideresiduen, gecorrigeerd voor het terminale fosfaat. Voor enkelstrengs DNA gebruikt de calculator de standaard waarden per residu (A 313,21, T 304,20, C 289,18, G 329,21 g/mol) min 61,96; enkelstrengs RNA gebruikt de ribonucleotidewaarden met U in plaats van T. Dubbelstrengs DNA is de som van de sense-streng en zijn complement.
Vul een sequentie in en kies het molecultype. FASTA-headers, spaties en cijfers worden genegeerd, en het resultaat wordt getoond in g/mol en kilodalton. Deze anhydrische waarden komen overeen met de cijfers op oligo-synthesespecificatiebladen.
Voorbeelden
- ssDNA ACGT = 1173,84 g/mol.
- ssRNA ACGU = 1223,81 g/mol.
- dsDNA is de som van beide complementaire strengen.
Veelgestelde vragen
- Hoe wordt het molecuulgewicht van een oligo berekend?
- Door de molecuulgewichten van elk nucleotideresidu op te tellen en 61,96 af te trekken voor de verwijdering van het terminale fosfaat. Voor DNA en RNA worden verschillende residumassa's gebruikt.
- Wat is het verschil tussen het gewicht van ssDNA en dsDNA?
- Enkelstrengs DNA telt één streng; dubbelstrengs DNA voegt de complementaire streng toe, dus het molecuulgewicht is ongeveer twee keer dat van de enkele streng.
- Waarom wijkt mijn synthesespecificatieblad enigszins af?
- Kleine verschillen ontstaan door chemische modificaties, 5'-fosfaten of andere eindchemie. De calculator gebruikt de standaard ongemodificeerde anhydrische waarden.
- Kan ik het gebruiken voor RNA?
- Ja. Selecteer ssRNA en de calculator gebruikt ribonucleotidemassa's, waarbij T wordt behandeld als U zodat je beide alfabetten kunt plakken.