DNA / RNA分子量計算ツール
オリゴヌクレオチドの配列から分子量を計算します。一本鎖DNA、二本鎖DNA、一本鎖RNAを選択してください。計算ツールは標準的な式を使って残基質量を合計します。
ヌクレオチド配列（A, C, G, T/U）を入力すると分子量が計算されます。
使い方
オリゴヌクレオチドの分子量は、末端リン酸を調整したヌクレオチド残基の質量の合計です。一本鎖DNAの場合、計算ツールは標準的な残基あたりの値 (A 313.21、T 304.20、C 289.18、G 329.21 g/mol) から61.96を引いた値を使用します。一本鎖RNAはTの代わりにUを用いたリボヌクレオチドの値を使用します。二本鎖DNAは、センス鎖とその相補鎖の合計です。
配列を入力し、分子タイプを選択してください。FASTAヘッダー、スペース、数字は無視され、結果はg/molとキロダルトンで表示されます。これらの無水値は、オリゴ合成の仕様書に記載されている数値と一致します。
使用例
- ssDNA ACGT = 1173.84 g/mol。
- ssRNA ACGU = 1223.81 g/mol。
- dsDNAは両方の相補鎖の合計です。
よくある質問
- オリゴの分子量はどのように計算されますか？
- 各ヌクレオチド残基の分子量を合計し、末端リン酸の除去分として61.96を引いて計算されます。DNAとRNAでは異なる残基質量が使われます。
- ssDNAとdsDNAの重量の違いは何ですか？
- 一本鎖DNAは1本の鎖をカウントします。二本鎖DNAは相補鎖を加えるため、その分子量は一本鎖のおよそ2倍になります。
- 合成仕様書とわずかに異なるのはなぜですか？
- 化学修飾、5'リン酸、または異なる末端化学の違いから小さな差が生じます。この計算ツールは標準的な無修飾の無水値を使用しています。
- RNAにも使えますか？
- はい。ssRNAを選択すると、計算ツールはリボヌクレオチドの質量を使用し、TをUとして扱うため、どちらのアルファベットでも貼り付けることができます。