Traduzione proteica
Traduci una sequenza codificante di DNA o RNA in una proteina usando il codice genetico standard. Scegli una fase di lettura e, se vuoi, fermati al primo codone di stop. Accetta input FASTA e U viene letta come T.
Incolla una sequenza codificante sopra per tradurla.
Come funziona
Il codice genetico legge una sequenza nucleotidica tre basi alla volta. Ogni tripletta, o codone, specifica un amminoacido, e tre dei 64 codoni segnalano la fine della traduzione. Questo strumento divide la tua sequenza in codoni a partire dalla fase di lettura scelta e cerca ciascuno di essi nel codice genetico standard (tabella NCBI 1), scrivendo gli amminoacidi come codici a lettera singola e i codoni di stop come un asterisco.
Poiché una sequenza può essere letta in tre fasi in avanti a seconda di dove inizi, scegli la fase che inizia al vero codone di inizio (di solito ATG). Attiva “fermati al primo codone di stop” per tradurre solo la fase di lettura aperta fino al suo terminatore. L'uracile nell'RNA viene trattato come timina, e le intestazioni FASTA, gli spazi e i numeri vengono ignorati.
Esempi
- ATGGCC → M A (Met-Ala).
- ATG TTT TAA → M F * (una breve fase di lettura aperta che termina con uno stop).
- Spostandosi alla fase +2 di AATGGCC si legge ATG GCC → M A.
Domande frequenti
- Cos'è una fase di lettura?
- Una fase di lettura è dove inizi a raggruppare le basi in triplette. Una sequenza ha tre possibili fasi in avanti (a partire dalla posizione 1, 2 o 3), e quella corretta inizia al codone di inizio.
- Quale codice genetico viene usato?
- Il codice genetico standard (tabella di traduzione NCBI 1), che si applica alla maggior parte dei geni nucleari. I codici degli organelli e alcuni codici specifici di organismo differiscono per alcuni codoni.
- Cosa significa l'asterisco?
- Un asterisco indica un codone di stop (TAA, TAG o TGA), che termina la traduzione. Attiva “fermati al primo codone di stop” per terminare la proteina lì.
- Traduce l'RNA?
- Sì. L'uracile (U) viene letto come timina (T), quindi una sequenza di mRNA si traduce nella stessa proteina del suo DNA.