Calcolatore del peso molecolare di DNA / RNA
Calcola il peso molecolare di un oligonucleotide dalla sua sequenza. Scegli DNA a singolo filamento, DNA a doppio filamento o RNA a singolo filamento; il calcolatore somma le masse dei residui usando le formule standard.
Inserisci una sequenza nucleotidica (A, C, G, T/U) per calcolarne il peso molecolare.
Come funziona
Il peso molecolare di un oligonucleotide è la somma delle masse dei suoi residui nucleotidici, corretta per il fosfato terminale. Per il DNA a singolo filamento il calcolatore usa i valori standard per residuo (A 313,21, T 304,20, C 289,18, G 329,21 g/mol) meno 61,96; l'RNA a singolo filamento usa i valori ribonucleotidici con U al posto di T. Il DNA a doppio filamento è la somma del filamento senso e del suo complemento.
Inserisci una sequenza e scegli il tipo di molecola. Le intestazioni FASTA, gli spazi e i numeri vengono ignorati, e il risultato viene mostrato in g/mol e kilodalton. Questi valori anidri corrispondono alle cifre riportate sui fogli di specifica della sintesi degli oligo.
Esempi
- ssDNA ACGT = 1173,84 g/mol.
- ssRNA ACGU = 1223,81 g/mol.
- Il dsDNA è la somma di entrambi i filamenti complementari.
Domande frequenti
- Come si calcola il peso molecolare dell'oligo?
- Sommando i pesi molecolari di ciascun residuo nucleotidico e sottraendo 61,96 per la rimozione del fosfato terminale. Per DNA e RNA vengono usate masse dei residui diverse.
- Qual è la differenza tra il peso di ssDNA e dsDNA?
- Il DNA a singolo filamento conta un solo filamento; il DNA a doppio filamento aggiunge il filamento complementare, quindi il suo peso molecolare è circa il doppio di quello del singolo filamento.
- Perché il mio foglio di sintesi differisce leggermente?
- Piccole differenze derivano da modifiche chimiche, fosfati 5' o diverse chimiche terminali. Il calcolatore usa i valori anidri standard non modificati.
- Posso usarlo per l'RNA?
- Sì. Seleziona ssRNA e il calcolatore usa le masse ribonucleotidiche, trattando T come U così puoi incollare entrambi gli alfabeti.