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Calculateur de complément inverse

Collez une séquence d'ADN ou d'ARN pour obtenir son complément inverse, son complément ou son inverse. Les codes d'ambiguïté IUPAC sont gérés et les en-têtes FASTA, espaces et chiffres sont ignorés.

Collez une séquence ci-dessus pour voir le résultat.

Comment ça marche

Le complément d'un brin d'ADN associe chaque base à son partenaire Watson-Crick : A avec T, G avec C (et A avec U dans l'ARN). Le complément inverse inverse ce brin complémenté, donnant la séquence que vous liriez sur le brin opposé dans le sens 5′→3′ — exactement ce dont vous avez besoin pour concevoir une amorce inverse ou interpréter le brin antisens.

Collez une séquence et choisissez complément inverse, complément seul, ou inverse seul. Les codes d'ambiguïté IUPAC (R, Y, N et les autres) sont complémentés correctement, et tout ce qui n'est pas une lettre — en-têtes FASTA, sauts de ligne, espaces, numéros de position — est supprimé avant le traitement. Cochez sortie ARN pour écrire le résultat avec U au lieu de T.

Exemples

  • ATGC → complément inverse → GCAT.
  • 5′-ATGCTAGC-3′ → complément inverse → GCTAGCAT (l'amorce du brin inverse).
  • Codes d'ambiguïté : R (A/G) se complémente en Y (C/T).

Questions fréquentes

Qu'est-ce qu'un complément inverse ?
C'est la séquence du brin d'ADN opposé lue 5′→3′. Vous complémentez chaque base (A↔T, G↔C) puis inversez l'ordre.
Gère-t-il l'ARN ?
Oui. Cochez sortie ARN et le résultat est écrit avec U à la place de T. U dans l'entrée est traité comme équivalent à T.
Qu'en est-il des codes d'ambiguïté ?
Tous les codes nucléotidiques IUPAC sont pris en charge et complémentés correctement, par exemple R (purine) devient Y (pyrimidine) et N reste N.
Puis-je coller du FASTA ?
Oui. Les lignes commençant par > sont ignorées, et les espaces et chiffres sont supprimés automatiquement, vous pouvez donc coller directement depuis un fichier FASTA.