Traduction de protéines
Traduisez une séquence codante d'ADN ou d'ARN en protéine à l'aide du code génétique standard. Choisissez un cadre de lecture et, si vous le souhaitez, arrêtez au premier codon stop. L'entrée FASTA est acceptée et U est lu comme T.
Collez une séquence codante ci-dessus pour la traduire.
Comment ça marche
Le code génétique lit une séquence nucléotidique trois bases à la fois. Chaque triplet, ou codon, spécifie un acide aminé, et trois des 64 codons signalent la fin de la traduction. Cet outil découpe votre séquence en codons à partir du cadre de lecture choisi et recherche chacun dans le code génétique standard (table 1 du NCBI), en écrivant les acides aminés sous forme de codes à une lettre et les codons stop sous forme d'astérisque.
Comme une séquence peut être lue selon trois cadres avant selon l'endroit où vous commencez, choisissez le cadre qui commence au véritable codon d'initiation (généralement ATG). Activez « arrêter au premier codon stop » pour ne traduire que le cadre de lecture ouvert jusqu'à son terminateur. L'uracile de l'ARN est traité comme la thymine, et les en-têtes FASTA, espaces et chiffres sont ignorés.
Exemples
- ATGGCC → M A (Met-Ala).
- ATG TTT TAA → M F * (un court cadre de lecture ouvert se terminant par un stop).
- Le passage au cadre +2 de AATGGCC lit ATG GCC → M A.
Questions fréquentes
- Qu'est-ce qu'un cadre de lecture ?
- Un cadre de lecture est l'endroit où vous commencez à grouper les bases en triplets. Une séquence a trois cadres avant possibles (commençant à la position 1, 2 ou 3), et le bon commence au codon d'initiation.
- Quel code génétique est utilisé ?
- Le code génétique standard (table de traduction 1 du NCBI), qui s'applique à la plupart des gènes nucléaires. Les codes des organites et de certains organismes spécifiques diffèrent pour quelques codons.
- Que signifie l'astérisque ?
- Un astérisque marque un codon stop (TAA, TAG ou TGA), qui met fin à la traduction. Activez « arrêter au premier codon stop » pour terminer la protéine à cet endroit.
- Traduit-il l'ARN ?
- Oui. L'uracile (U) est lu comme la thymine (T), donc une séquence d'ARNm se traduit en la même protéine que son ADN.