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Calculateur de masse moléculaire ADN / ARN

Calculez la masse moléculaire d'un oligonucléotide à partir de sa séquence. Choisissez ADN simple brin, ADN double brin ou ARN simple brin ; le calculateur additionne les masses de résidus à l'aide des formules standards.

Entrez une séquence nucléotidique (A, C, G, T/U) pour calculer sa masse moléculaire.

Comment ça marche

La masse moléculaire d'un oligonucléotide est la somme des masses de ses résidus nucléotidiques, ajustée pour le phosphate terminal. Pour l'ADN simple brin, le calculateur utilise les valeurs standards par résidu (A 313,21, T 304,20, C 289,18, G 329,21 g/mol) moins 61,96 ; l'ARN simple brin utilise les valeurs ribonucléotidiques avec U à la place de T. L'ADN double brin est la somme du brin sens et de son complément.

Entrez une séquence et choisissez le type de molécule. Les en-têtes FASTA, espaces et chiffres sont ignorés, et le résultat est affiché en g/mol et en kilodaltons. Ces valeurs anhydres correspondent aux chiffres rapportés sur les fiches de spécification de synthèse d'oligos.

Exemples

  • ADNsb ACGT = 1173,84 g/mol.
  • ARNsb ACGU = 1223,81 g/mol.
  • L'ADNdb est la somme des deux brins complémentaires.

Questions fréquentes

Comment la masse moléculaire d'un oligo est-elle calculée ?
En additionnant les masses moléculaires de chaque résidu nucléotidique et en soustrayant 61,96 pour la suppression du phosphate terminal. Des masses de résidus différentes sont utilisées pour l'ADN et l'ARN.
Quelle est la différence entre la masse de l'ADNsb et de l'ADNdb ?
L'ADN simple brin compte un seul brin ; l'ADN double brin ajoute le brin complémentaire, donc sa masse moléculaire est environ le double de celle du brin simple.
Pourquoi ma fiche de synthèse diffère-t-elle légèrement ?
De petites différences proviennent de modifications chimiques, de phosphates en 5' ou de chimies terminales différentes. Le calculateur utilise les valeurs anhydres standards non modifiées.
Puis-je l'utiliser pour l'ARN ?
Oui. Sélectionnez ARNsb et le calculateur utilise les masses ribonucléotidiques, traitant T comme U afin que vous puissiez coller l'un ou l'autre alphabet.