Conversor de Puntuación de Calidad Phred
Convierte una puntuación de calidad Phred en su probabilidad de error de llamada de base y precisión, y visualiza los caracteres ASCII Phred+33 y Phred+64 usados en archivos FASTQ. También puedes convertir una probabilidad de error de vuelta a una puntuación Q.
- Probabilidad de error
- 1.00e-2
- Carácter Phred+33
- 5
- Carácter Phred+64
- T
Introduce una probabilidad de error entre 0 y 1 para obtener la puntuación Q.
Cómo funciona
Una puntuación de calidad Phred Q codifica la probabilidad P de que una llamada de base sea incorrecta, en una escala logarítmica: P = 10^(−Q/10), por lo que Q = −10 × log10(P). Una puntuación más alta significa una llamada más confiable — Q20 es una tasa de error de 1 en 100 (99% de precisión), Q30 es de 1 en 1000 (99.9%), y Q40 es de 1 en 10000 (99.99%).
En los archivos FASTQ, la puntuación se almacena como un único carácter ASCII. Sanger y el Illumina moderno usan Phred+33 (sumar 33 a Q y tomar ese carácter), mientras que las canalizaciones antiguas de Illumina usaban Phred+64. Introduce una puntuación Q para ver su probabilidad, precisión y ambos caracteres, o introduce una probabilidad de error para obtener la Q equivalente.
Ejemplos
- Q20 → probabilidad de error 1e-2 → 99% de precisión → carácter Phred+33 '5'.
- Q30 → 1e-3 → 99.9% de precisión → carácter Phred+33 '?'.
- Q40 → 1e-4 → 99.99% de precisión → carácter Phred+33 'I'.
Preguntas frecuentes
- ¿Qué es una puntuación de calidad Phred?
- Es una medida de la confianza de una llamada de base en la secuenciación de ADN, definida como Q = −10 × log10(P), donde P es la probabilidad de que la llamada sea incorrecta.
- ¿Cuál es la diferencia entre Phred+33 y Phred+64?
- Son dos codificaciones ASCII de la puntuación en archivos FASTQ. Phred+33 (Sanger, Illumina 1.8+) suma 33 a Q; Phred+64 (Illumina antiguo) suma 64. Se necesita el desplazamiento correcto para decodificar las calidades.
- ¿Qué precisión significa Q30?
- Q30 corresponde a una probabilidad de error de 0.001, o 99.9% de precisión de llamada de base — una base incorrecta en mil. Es un umbral de calidad común para las lecturas de secuenciación.
- ¿Cómo convierto probabilidad a Q?
- Usa Q = −10 × log10(P). Introduce la probabilidad de error en el segundo campo y la calculadora devuelve la puntuación Q.