Calculadora de Contenido GC
Pega una secuencia de ADN o ARN para obtener su contenido GC, contenido AT y composición de bases. Las cabeceras FASTA, espacios y números se ignoran, y la U se cuenta como T.
Pega una secuencia arriba para ver su contenido GC.
Cómo funciona
El contenido GC es la fracción de bases en un ácido nucleico que son guanina (G) o citosina (C), expresada como porcentaje: %GC = (G + C) ÷ (A + T + G + C) × 100. Como los pares de bases G-C se mantienen unidos por tres enlaces de hidrógeno en lugar de dos, el contenido GC se correlaciona con la temperatura de fusión y la estabilidad de la secuencia.
Pega una secuencia y la calculadora informa el porcentaje de GC, el porcentaje complementario de AT, la longitud y el conteo de cada base. Las cabeceras FASTA, saltos de línea, espacios y números se eliminan automáticamente, y el uracilo (U) en el ARN se cuenta junto con la timina (T).
Ejemplos
- GGCC → contenido GC 100%.
- ATGC → contenido GC 50%, contenido AT 50%.
- Una región con 60% de GC funde a una temperatura más alta que una región con 40% de GC de la misma longitud.
Preguntas frecuentes
- ¿Qué es el contenido GC?
- El contenido GC es el porcentaje de una secuencia compuesto por guanina y citosina. Se calcula como (G + C) dividido entre el número total de bases, multiplicado por 100.
- ¿Por qué es importante el contenido GC?
- Los pares G-C tienen tres enlaces de hidrógeno frente a dos de A-T, por lo que un mayor contenido GC aumenta la temperatura de fusión y la estabilidad del ADN. También afecta al diseño de cebadores de PCR y refleja características del genoma.
- ¿Funciona con ARN?
- Sí. El uracilo (U) se cuenta como timina (T), así que las secuencias de ARN dan el contenido GC esperado.
- ¿Qué entrada puedo pegar?
- Secuencia simple o FASTA. Las líneas que comienzan con > se ignoran y los espacios en blanco y números se eliminan, así que pegar directamente desde un archivo FASTA funciona.