Rechner für reverses Komplement
Fügen Sie eine DNA- oder RNA-Sequenz ein, um ihr reverses Komplement, Komplement oder ihre Umkehrung zu erhalten. IUPAC-Mehrdeutigkeitscodes werden verarbeitet, und FASTA-Header, Leerzeichen und Zahlen werden ignoriert.
Fügen Sie oben eine Sequenz ein, um das Ergebnis zu sehen.
So funktioniert es
Das Komplement eines DNA-Strangs paart jede Base mit ihrem Watson-Crick-Partner: A mit T, G mit C (und A mit U in RNA). Das reverse Komplement kehrt diesen komplementierten Strang um und ergibt die Sequenz, die Sie auf dem gegenüberliegenden Strang in 5′→3′-Richtung lesen würden — genau das, was Sie beim Entwerfen eines Reverse-Primers oder beim Interpretieren des Antisense-Strangs benötigen.
Fügen Sie eine Sequenz ein und wählen Sie reverses Komplement, nur Komplement oder nur Umkehrung. IUPAC-Mehrdeutigkeitscodes (R, Y, N und die übrigen) werden korrekt komplementiert, und alles, was kein Buchstabe ist — FASTA-Header, Zeilenumbrüche, Leerzeichen, Positionsnummern — wird vor der Verarbeitung entfernt. Aktivieren Sie RNA-Ausgabe, um das Ergebnis mit U statt T zu schreiben.
Beispiele
- ATGC → reverses Komplement → GCAT.
- 5′-ATGCTAGC-3′ → reverses Komplement → GCTAGCAT (der Primer für den Gegenstrang).
- Mehrdeutigkeitscodes: R (A/G) wird zu Y (C/T) komplementiert.
Häufig gestellte Fragen
- Was ist ein reverses Komplement?
- Es ist die Sequenz des gegenüberliegenden DNA-Strangs, gelesen 5′→3′. Sie komplementieren jede Base (A↔T, G↔C) und kehren dann die Reihenfolge um.
- Wird RNA unterstützt?
- Ja. Aktivieren Sie RNA-Ausgabe, und das Ergebnis wird mit U anstelle von T geschrieben. U in der Eingabe wird als gleichwertig mit T behandelt.
- Was ist mit Mehrdeutigkeitscodes?
- Alle IUPAC-Nukleotidcodes werden unterstützt und korrekt komplementiert, zum Beispiel wird R (Purin) zu Y (Pyrimidin) und N bleibt N.
- Kann ich FASTA einfügen?
- Ja. Zeilen, die mit > beginnen, werden ignoriert, und Leerzeichen sowie Zahlen werden automatisch entfernt, sodass Sie direkt aus einer FASTA-Datei einfügen können.