Proteinübersetzung
Übersetzen Sie eine DNA- oder RNA-Kodierungssequenz mithilfe des Standard-genetischen Codes in ein Protein. Wählen Sie ein Leseraster und stoppen Sie bei Bedarf am ersten Stoppcodon. FASTA-Eingabe wird akzeptiert, und U wird als T gelesen.
Fügen Sie oben eine Kodierungssequenz ein, um sie zu übersetzen.
So funktioniert es
Der genetische Code liest eine Nukleotidsequenz jeweils drei Basen auf einmal. Jedes Triplett, oder Codon, spezifiziert eine Aminosäure, und drei der 64 Codons signalisieren das Ende der Übersetzung. Dieses Tool teilt Ihre Sequenz in Codons auf, beginnend beim gewählten Leseraster, und schlägt jedes im Standard-genetischen Code (NCBI-Tabelle 1) nach, wobei die Aminosäuren als Einzelbuchstabencodes und Stoppcodons als Sternchen geschrieben werden.
Da eine Sequenz je nach Startpunkt in drei Vorwärts-Leserastern gelesen werden kann, wählen Sie das Leseraster, das beim tatsächlichen Startcodon beginnt (meist ATG). Aktivieren Sie „Am ersten Stoppcodon anhalten“, um nur den offenen Leserahmen bis zu seinem Terminator zu übersetzen. Uracil in RNA wird als Thymin behandelt, und FASTA-Header, Leerzeichen und Zahlen werden ignoriert.
Beispiele
- ATGGCC → M A (Met-Ala).
- ATG TTT TAA → M F * (ein kurzer offener Leserahmen, der mit einem Stopp endet).
- Verschiebung zu Raster +2 von AATGGCC liest ATG GCC → M A.
Häufig gestellte Fragen
- Was ist ein Leseraster?
- Ein Leseraster ist die Stelle, an der Sie beginnen, Basen zu Tripletts zu gruppieren. Eine Sequenz hat drei mögliche Vorwärts-Leseraster (beginnend bei Position 1, 2 oder 3), und das richtige beginnt beim Startcodon.
- Welcher genetische Code wird verwendet?
- Der Standard-genetische Code (NCBI-Übersetzungstabelle 1), der für die meisten Kerngene gilt. Organellen- und einige organismenspezifische Codes unterscheiden sich bei einigen Codons.
- Was bedeutet das Sternchen?
- Ein Sternchen markiert ein Stoppcodon (TAA, TAG oder TGA), das die Übersetzung beendet. Aktivieren Sie „Am ersten Stoppcodon anhalten“, um das Protein dort zu beenden.
- Übersetzt es RNA?
- Ja. Uracil (U) wird als Thymin (T) gelesen, sodass eine mRNA-Sequenz zum gleichen Protein wie ihre DNA übersetzt wird.