GC-Gehalt-Rechner
Fügen Sie eine DNA- oder RNA-Sequenz ein, um ihren GC-Gehalt, AT-Gehalt und ihre Basenzusammensetzung zu erhalten. FASTA-Header, Leerzeichen und Zahlen werden ignoriert, und U wird als T gezählt.
Fügen Sie oben eine Sequenz ein, um ihren GC-Gehalt zu sehen.
So funktioniert es
Der GC-Gehalt ist der Anteil der Basen in einer Nukleinsäure, die entweder Guanin (G) oder Cytosin (C) sind, ausgedrückt als Prozentsatz: GC% = (G + C) ÷ (A + T + G + C) × 100. Da G-C-Basenpaare durch drei Wasserstoffbrücken statt zwei zusammengehalten werden, korreliert der GC-Gehalt mit der Schmelztemperatur und Stabilität der Sequenz.
Fügen Sie eine Sequenz ein, und der Rechner gibt den GC-Prozentsatz, den komplementären AT-Prozentsatz, die Länge und die Anzahl jeder Base aus. FASTA-Header, Zeilenumbrüche, Leerzeichen und Zahlen werden automatisch entfernt, und Uracil (U) in RNA wird zusammen mit Thymin (T) gezählt.
Beispiele
- GGCC → GC-Gehalt 100%.
- ATGC → GC-Gehalt 50%, AT-Gehalt 50%.
- Eine Region mit 60% GC-Gehalt schmilzt bei einer höheren Temperatur als eine Region mit 40% GC-Gehalt gleicher Länge.
Häufig gestellte Fragen
- Was ist der GC-Gehalt?
- Der GC-Gehalt ist der Prozentsatz einer Sequenz, der aus Guanin und Cytosin besteht. Er wird berechnet als (G + C) geteilt durch die Gesamtzahl der Basen, mal 100.
- Warum ist der GC-Gehalt wichtig?
- G-C-Paare haben drei Wasserstoffbrücken gegenüber zwei bei A-T, sodass ein höherer GC-Gehalt die Schmelztemperatur und Stabilität der DNA erhöht. Er beeinflusst auch das Design von PCR-Primern und spiegelt Genommerkmale wider.
- Funktioniert es für RNA?
- Ja. Uracil (U) wird als Thymin (T) gezählt, sodass RNA-Sequenzen den erwarteten GC-Gehalt ergeben.
- Welche Eingabe kann ich einfügen?
- Reine Sequenz oder FASTA. Zeilen, die mit > beginnen, werden ignoriert, und Leerzeichen sowie Zahlen werden entfernt, sodass das Einfügen direkt aus einer FASTA-Datei funktioniert.