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DNA-/RNA-Molekulargewichtsrechner

Berechnen Sie das Molekulargewicht eines Oligonukleotids aus seiner Sequenz. Wählen Sie einzelsträngige DNA, doppelsträngige DNA oder einzelsträngige RNA; der Rechner summiert die Residuenmassen nach den Standardformeln.

Geben Sie eine Nukleotidsequenz (A, C, G, T/U) ein, um ihr Molekulargewicht zu berechnen.

So funktioniert es

Das Molekulargewicht eines Oligonukleotids ist die Summe der Massen seiner Nukleotidreste, angepasst um das terminale Phosphat. Für einzelsträngige DNA verwendet der Rechner die Standardwerte pro Rest (A 313,21, T 304,20, C 289,18, G 329,21 g/mol) minus 61,96; einzelsträngige RNA verwendet die Ribonukleotidwerte mit U anstelle von T. Doppelsträngige DNA ist die Summe des Sinnstrangs und seines Komplements.

Geben Sie eine Sequenz ein und wählen Sie den Molekültyp. FASTA-Header, Leerzeichen und Zahlen werden ignoriert, und das Ergebnis wird in g/mol und Kilodalton angezeigt. Diese wasserfreien Werte stimmen mit den auf Oligo-Synthese-Spezifikationsblättern angegebenen Zahlen überein.

Beispiele

  • ssDNA ACGT = 1173,84 g/mol.
  • ssRNA ACGU = 1223,81 g/mol.
  • dsDNA ist die Summe beider komplementären Stränge.

Häufig gestellte Fragen

Wie wird das Molekulargewicht eines Oligos berechnet?
Durch Summieren der Molekulargewichte jedes Nukleotidrests und Abziehen von 61,96 für die Entfernung des terminalen Phosphats. Für DNA und RNA werden unterschiedliche Restmassen verwendet.
Was ist der Unterschied zwischen ssDNA- und dsDNA-Gewicht?
Einzelsträngige DNA zählt einen Strang; doppelsträngige DNA addiert den komplementären Strang, sodass ihr Molekulargewicht etwa doppelt so hoch ist wie das des Einzelstrangs.
Warum weicht mein Synthese-Datenblatt leicht ab?
Kleine Unterschiede entstehen durch chemische Modifikationen, 5'-Phosphate oder unterschiedliche Endchemien. Der Rechner verwendet die standardmäßigen unmodifizierten wasserfreien Werte.
Kann ich es für RNA verwenden?
Ja. Wählen Sie ssRNA, und der Rechner verwendet Ribonukleotidmassen, wobei T als U behandelt wird, sodass Sie beide Alphabete einfügen können.